به طور كلي ، موتورهاي سانتريفيوژ موتورهاي با گشتاور بالا و سري پيچيده هستند كه با افزايش ولتاژ چرخش آنها افزايش مي يابد. شافت روتور مستقيماً يا از طريق يك ژيروسكوپ هدايت مي شود ، اگرچه گاهي اوقات از سيستم قرقره استفاده مي شود. تماس برق با كموتاتور از طريق قلم موهاي گرافيتي فراهم مي شود كه با فشار دادن روي چرخش كموتاتور با سرعت زياد كم كم فرسوده مي شوند و بنابراين بايد در فواصل زماني مشخص تعويض شوند. سانتريفيوژهاي مدرن داراي موتور محرك القايي هستند كه فاقد برس براي تعويض هستند. شافت موتور از طريق ياتاقان هاي آستين واقع در بالا و پايين موتور مي چرخد. اكثر ابزارها حاوي ياتاقانهاي مهر و موم شده هستند كه به طور دائمي روغن كاري مي شوند ، در حالي كه ديگر نياز به استفاده دوره اي روغن يا گريس دارند.سرعت سانتريفيوژ توسط پتانسيومتر كنترل مي شود كه ولتاژ ارائه شده به موتور را بالا و پايين مي آورد. كاليبراسيون روي كنترل سرعت غالباً فقط ولتاژ نسبي است و هرگز نبايد به عنوان شاخص هاي دقيق سرعت در نظر گرفته شود. بنابراين ، كاليبراسيون مجدد دوره اي مورد نياز است.بعضي از ابزارها داراي يك آشكارساز عدم تعادل داخلي هستند كه در هنگام كار روتور را كنترل مي كند و در صورت عدم تعادل شديد بارهاي روتور باعث خاموش شدن خودكار مي شود.دور سنج نشان دهنده سرعت در دور در دقيقه است. در اكثر سانتريفيوژهاي مودم از سرعت سنج هاي الكترونيكي استفاده مي شود كه در آن آهنربا دور سيم پيچ مي چرخد ​​تا جرياني توليد كند كه قابل اندازه گيري باشد.سانتريفيوژهاي مودم بايد از مكانيزم قفل درب براي جلوگيري از باز شدن درب در هنگام كار دستگاه استفاده كنند. اگر به دلايلي قطعي برق وجود داشته باشد يا قفل ايمني از كار بيفتد ، براي بازيابي نمونه ها لازم است مكانيسم قفل درب سانتريفيوژ را به صورت دستي قطع كنيد. دستورالعمل هاي سازندگان بايد از نظر روش دقيق مورد بررسي قرار گيرند.

مقدار RCF را مي توان با استفاده از نموگرام نيز بدست آورد . با استفاده از يك خط كش لبه راست ، شعاع چرخشي شناخته شده (فاصله از مركز روتور تا پايين سطل سانتريفيوژ) را در سمت چپ با دور مشخص در سمت راست راست قرار دهيد و مقدار RCF را در جايي كه خط عبور مي كند بخوانيد نمودار در مركز. طراحي اكثر سانتريفيوژها به سيستم درايو اجازه مي دهد روتورهايي با اندازه و ظرفيت هاي مختلف را بپذيرد. با اين حال ، بيشتر روتورهاي ابزار اكنون قادر به پذيرش طيف وسيعي از اندازه لوله ها با استفاده از آداپتورها هستند. روتورها داراي سه طرح اساسي هستند: افقي ، كه در آن لوله ها در سطل هايي حمل مي شوند كه مي توانند به سمت خارج به حالت افقي درآيند و مي توانند با سرعت حدود 3000 دور در دقيقه كار كنند. زاويه ، كه در آن لوله هاي نمونه با زاويه نسبت به موقعيت عمودي نگه داشته مي شوند و به دليل ساخت آيروديناميكي روتور مي توانند سرعت هاي بسيار بالاتري (تقريباً 7000 دور در دقيقه) را بدست آورند. و عمودي  ، كه در آن لوله ها در موقعيت عمودي قرار مي گيرند. به طور كلي ، روتور افقي مزايايي را به آزمايشگاه باليني ارائه مي دهد زيرا رسوب ذرات بزرگ (به عنوان مثال ، گلبول هاي قرمز) در نيروي كم كارآمد است و به دليل توليد رسوب بار روتور هميشه بايد قبل از كار با سانتريفيوژ متعادل باشد ، به خصوص هنگام استفاده از ابزارهاي پرسرعت كه در آنها سطل ها و درب ها اغلب شماره گذاري مي شوند. به اين ترتيب مي توان آنها را در دو طرف مخالف روتور تطبيق داد.بار بايد هم با جرم مساوي و هم با مراكز ثقل در مركز چرخش متعادل شود. بنابراين ، مهم است كه فروش سانتريفيوژ را با سطل ها ، حامل ها يا سپرهاي موجود در واحد كار نكنيد و از حداكثر سرعت نامي روتور مورد استفاده فراتر نرويد. اكثر روتورهاي مدرن داراي شناسايي روتور اتوماتيك كنترل شده توسط ريزپردازنده هستند به طوري كه تنظيم سرعت بيش از حد ايمني آن روتور غيرممكن است.